单细胞多组学速度模型学会扰动:在Arid1a缺失B细胞里点名三个可救靶点,小鼠验证全部奏效
DynaVelo把单细胞多组学中的RNA表达与转录因子基序可及性放进同一个神经微分方程,学出可被干预的速度场,而不只是画轨迹。在野生型小鼠生发中心B细胞上,它复现暗区增殖、向亮区转换与再循环的分支;在Arid1a杂合缺失细胞上,它提名Ctcf、Stat3和Bcl6为挽救靶点,三种双杂合小鼠的暗区表型均被拉回。
DynaVelo把单细胞多组学中的RNA表达与转录因子基序可及性放进同一个神经微分方程,学出可被干预的速度场,而不只是画轨迹。在野生型小鼠生发中心B细胞上,它复现暗区增殖、向亮区转换与再循环的分支;在Arid1a杂合缺失细胞上,它提名Ctcf、Stat3和Bcl6为挽救靶点,三种双杂合小鼠的暗区表型均被拉回。
在顺铂处理的活细胞延时显微视频上,一个直接以原始图像序列为输入的Transformer模型把凋亡与分裂的判别做到平衡准确率0.94,并在事件发生前最多8小时就能给出可靠预测。
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