单细胞多组学速度模型学会扰动:在Arid1a缺失B细胞里点名三个可救靶点,小鼠验证全部奏效
DynaVelo把单细胞多组学中的RNA表达与转录因子基序可及性放进同一个神经微分方程,学出可被干预的速度场,而不只是画轨迹。在野生型小鼠生发中心B细胞上,它复现暗区增殖、向亮区转换与再循环的分支;在Arid1a杂合缺失细胞上,它提名Ctcf、Stat3和Bcl6为挽救靶点,三种双杂合小鼠的暗区表型均被拉回。
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DynaVelo把单细胞多组学中的RNA表达与转录因子基序可及性放进同一个神经微分方程,学出可被干预的速度场,而不只是画轨迹。在野生型小鼠生发中心B细胞上,它复现暗区增殖、向亮区转换与再循环的分支;在Arid1a杂合缺失细胞上,它提名Ctcf、Stat3和Bcl6为挽救靶点,三种双杂合小鼠的暗区表型均被拉回。
该研究在WORD、AMOS、CT-1K和AbdomenAtlas四个腹部CT数据集上,用nnU-Net、MedSAM、TotalSegmentator及四个规模的STU-Net共七个模型生成伪标签,构造不同质量的标签版本,再以DynUNet在相同确定性训练设置下分别做域内训练和预训练加微调;结果显示域内性能与标签质量强正相关且呈非线性、数据量可部分补偿质量,而预训练后微调在绝大多数设置下显著优于无预训练基线,且预训练标签质量高低不再明显影响下游结果。
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