生命科学

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American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026年10月1日
研究通过可成药基因组siRNA筛选发现ADAMTS14调控YAP核转位，在IPF患者肺组织的单细胞与空间转录组中定位到ADAMTS14阳性、CTHRC1高表达的肌成纤维细胞群并富集于成纤维细胞灶，在IPF患者来源肺成纤维细胞中敲低或敲除ADAMTS14后促纤维化基因、基质体基因与TGFβ反应下降，机制上鉴定V型胶原为ADAMTS14底物，其加工不足导致COL1:COL5比例由约50:1变为约20:1、基质不稳定、黏着斑紊乱、FAK-AKT信号与力传导减弱。
研究通过可成药基因组siRNA筛选发现ADAMTS14调控YAP核转位，在IPF患者肺组织的单细胞与空间转录组中定位到ADAMTS14阳性、CTHRC1高表达的肌成纤维细胞群并富集于成纤维细胞灶，在IPF患者来源肺成纤维细胞中敲低或敲除ADAMTS14后促纤维化基因、基质体基因与TGFβ反应下降，机制上鉴定V型胶原为ADAMTS14底物，其加工不足导致COL1:COL5比例由约50:1变为约20:1、基质不稳定、黏着斑紊乱、FAK-AKT信号与力传导减弱。
ADAMTS14通过切割V型胶原维持基质稳定性，缺失后削弱YAP核转位与IPF成纤维细胞活化
研究通过可成药基因组siRNA筛选发现ADAMTS14调控YAP核转位，在IPF患者肺组织的单细胞与空间转录组中定位到ADAMTS14阳性、CTHRC1高表达的肌成纤维细胞群并富集于成纤维细胞灶，在IPF患者来源肺成纤维细胞中敲低或敲除ADAMTS14后促纤维化基因、基质体基因与TGFβ反应下降，机制上鉴定V型胶原为ADAMTS14底物，其加工不足导致COL1:COL5比例由约50:1变为约20:1、基质不稳定、黏着斑紊乱、FAK-AKT信号与力传导减弱。
研究通过可成药基因组siRNA筛选发现ADAMTS14调控YAP核转位，在IPF患者肺组织的单细胞与空间转录组中定位到ADAMTS14阳性、CTHRC1高表达的肌成纤维细胞群并富集于成纤维细胞灶，在IPF患者来源肺成纤维细胞中敲低或敲除ADAMTS14后促纤维化基因、基质体基因与TGFβ反应下降，机制上鉴定V型胶原为ADAMTS14底物，其加工不足导致COL1:COL5比例由约50:1变为约20:1、基质不稳定、黏着斑紊乱、FAK-AKT信号与力传导减弱。
发表出处待核验 2026年10月1日
这篇以强迫症（OCD）为例的综述梳理了大数据方法在回答该病三大问题——病因是什么、哪种治疗对谁最有效、如何扩大循证治疗可及性——上的进展与约束，指出ENIGMA-OCD等大规模汇总数据使部分既往效应被证实为小而可重复、另一些则无法在大样本中重现或实为药物效应，Global OCD Study在五个国际站点统一方法招募250名未服药OCD成人与250名匹配健康志愿者后发现病例-对照脑差异相对较少、而特定脑与认知指标同OC临床特征的关联更具信息量，并强调大数据本身不是目的，只有在清晰因果框架、假设驱动与临床锚定下才能推进精准精神医学。
这篇以强迫症（OCD）为例的综述梳理了大数据方法在回答该病三大问题——病因是什么、哪种治疗对谁最有效、如何扩大循证治疗可及性——上的进展与约束，指出ENIGMA-OCD等大规模汇总数据使部分既往效应被证实为小而可重复、另一些则无法在大样本中重现或实为药物效应，Global OCD Study在五个国际站点统一方法招募250名未服药OCD成人与250名匹配健康志愿者后发现病例-对照脑差异相对较少、而特定脑与认知指标同OC临床特征的关联更具信息量，并强调大数据本身不是目的，只有在清晰因果框架、假设驱动与临床锚定下才能推进精准精神医学。
以强迫症为例，综述指出大数据在精神科需区分病因与病理生理、并以假设驱动才能回答具体精神障碍的三大问题
这篇以强迫症（OCD）为例的综述梳理了大数据方法在回答该病三大问题——病因是什么、哪种治疗对谁最有效、如何扩大循证治疗可及性——上的进展与约束，指出ENIGMA-OCD等大规模汇总数据使部分既往效应被证实为小而可重复、另一些则无法在大样本中重现或实为药物效应，Global OCD Study在五个国际站点统一方法招募250名未服药OCD成人与250名匹配健康志愿者后发现病例-对照脑差异相对较少、而特定脑与认知指标同OC临床特征的关联更具信息量，并强调大数据本身不是目的，只有在清晰因果框架、假设驱动与临床锚定下才能推进精准精神医学。
这篇以强迫症（OCD）为例的综述梳理了大数据方法在回答该病三大问题——病因是什么、哪种治疗对谁最有效、如何扩大循证治疗可及性——上的进展与约束，指出ENIGMA-OCD等大规模汇总数据使部分既往效应被证实为小而可重复、另一些则无法在大样本中重现或实为药物效应，Global OCD Study在五个国际站点统一方法招募250名未服药OCD成人与250名匹配健康志愿者后发现病例-对照脑差异相对较少、而特定脑与认知指标同OC临床特征的关联更具信息量，并强调大数据本身不是目的，只有在清晰因果框架、假设驱动与临床锚定下才能推进精准精神医学。
Diabetes 2026年10月1日
研究对英国生物银行24,638名糖尿病前期参与者，用LASSO与弹性网络从核磁共振代谢组学标志物中筛出16项指标，再以k均值聚类在训练集（12,322人）中分出低、中、高代谢风险三个亚型，并在验证集（12,316人）中验证其2型糖尿病、心血管病和慢性肾病风险依次升高，同时发现饮食质量与结局的关联在不同亚型间存在差异，并以孟德尔随机化提示若干代谢标志物与结局可能存在因果联系。
研究对英国生物银行24,638名糖尿病前期参与者，用LASSO与弹性网络从核磁共振代谢组学标志物中筛出16项指标，再以k均值聚类在训练集（12,322人）中分出低、中、高代谢风险三个亚型，并在验证集（12,316人）中验证其2型糖尿病、心血管病和慢性肾病风险依次升高，同时发现饮食质量与结局的关联在不同亚型间存在差异，并以孟德尔随机化提示若干代谢标志物与结局可能存在因果联系。
英国生物银行24,638名糖尿病前期人群的代谢组学聚类分出三个亚型，其2型糖尿病、心血管病和慢性肾病风险依次升高
研究对英国生物银行24,638名糖尿病前期参与者，用LASSO与弹性网络从核磁共振代谢组学标志物中筛出16项指标，再以k均值聚类在训练集（12,322人）中分出低、中、高代谢风险三个亚型，并在验证集（12,316人）中验证其2型糖尿病、心血管病和慢性肾病风险依次升高，同时发现饮食质量与结局的关联在不同亚型间存在差异，并以孟德尔随机化提示若干代谢标志物与结局可能存在因果联系。
研究对英国生物银行24,638名糖尿病前期参与者，用LASSO与弹性网络从核磁共振代谢组学标志物中筛出16项指标，再以k均值聚类在训练集（12,322人）中分出低、中、高代谢风险三个亚型，并在验证集（12,316人）中验证其2型糖尿病、心血管病和慢性肾病风险依次升高，同时发现饮食质量与结局的关联在不同亚型间存在差异，并以孟德尔随机化提示若干代谢标志物与结局可能存在因果联系。
发表出处待核验 2026年10月1日
这篇综述横跨社区与登记调查、队列与生物样本库、电子健康记录、数字表型、脑影像、基因组学及其他组学、随机对照试验七个领域，梳理大数据在精神病学中的进展、约束与未来方向，指出大数据推动了跨学科研究并揭示了精神障碍机制的复杂性、异质性与变异性，但样本量大并不保证估计更精确，从大数据到临床应用的转化仍存在差距，未来需在数据质量与方法严谨性、概念模型与临床问题上同等用力。
这篇综述横跨社区与登记调查、队列与生物样本库、电子健康记录、数字表型、脑影像、基因组学及其他组学、随机对照试验七个领域，梳理大数据在精神病学中的进展、约束与未来方向，指出大数据推动了跨学科研究并揭示了精神障碍机制的复杂性、异质性与变异性，但样本量大并不保证估计更精确，从大数据到临床应用的转化仍存在差距，未来需在数据质量与方法严谨性、概念模型与临床问题上同等用力。
跨七个精神病学研究领域综述显示：大数据带来机制洞见与跨学科协作，但样本量本身并不保证更精确的估计，临床转化仍存差距
这篇综述横跨社区与登记调查、队列与生物样本库、电子健康记录、数字表型、脑影像、基因组学及其他组学、随机对照试验七个领域，梳理大数据在精神病学中的进展、约束与未来方向，指出大数据推动了跨学科研究并揭示了精神障碍机制的复杂性、异质性与变异性，但样本量大并不保证估计更精确，从大数据到临床应用的转化仍存在差距，未来需在数据质量与方法严谨性、概念模型与临床问题上同等用力。
这篇综述横跨社区与登记调查、队列与生物样本库、电子健康记录、数字表型、脑影像、基因组学及其他组学、随机对照试验七个领域，梳理大数据在精神病学中的进展、约束与未来方向，指出大数据推动了跨学科研究并揭示了精神障碍机制的复杂性、异质性与变异性，但样本量大并不保证估计更精确，从大数据到临床应用的转化仍存在差距，未来需在数据质量与方法严谨性、概念模型与临床问题上同等用力。
Nature News 2026年10月1日
一篇《自然》新闻报道介绍了一项发表于《Advanced Healthcare Materials》的小鼠研究，该研究改造了抗寄生虫药尼氯酰胺以靶向子宫内膜异位症相关细胞；同时，一篇《npj Women's Health》分析显示，在丹麦前100家资助型基金会中，子宫内膜异位症研究仅获得173,958欧元，而糖尿病获得254,908,430欧元、炎症性肠病获得325,940欧元，媒体提及量也相差悬殊。
一篇《自然》新闻报道介绍了一项发表于《Advanced Healthcare Materials》的小鼠研究，该研究改造了抗寄生虫药尼氯酰胺以靶向子宫内膜异位症相关细胞；同时，一篇《npj Women's Health》分析显示，在丹麦前100家资助型基金会中，子宫内膜异位症研究仅获得173,958欧元，而糖尿病获得254,908,430欧元、炎症性肠病获得325,940欧元，媒体提及量也相差悬殊。
丹麦基金会资助数据显示子宫内膜异位症研究仅获17.4万欧元，而糖尿病获2.55亿欧元；小鼠研究提示改造后的尼氯酰胺可逆转病灶诱导的巨噬细胞变化
一篇《自然》新闻报道介绍了一项发表于《Advanced Healthcare Materials》的小鼠研究，该研究改造了抗寄生虫药尼氯酰胺以靶向子宫内膜异位症相关细胞；同时，一篇《npj Women's Health》分析显示，在丹麦前100家资助型基金会中，子宫内膜异位症研究仅获得173,958欧元，而糖尿病获得254,908,430欧元、炎症性肠病获得325,940欧元，媒体提及量也相差悬殊。
一篇《自然》新闻报道介绍了一项发表于《Advanced Healthcare Materials》的小鼠研究，该研究改造了抗寄生虫药尼氯酰胺以靶向子宫内膜异位症相关细胞；同时，一篇《npj Women's Health》分析显示，在丹麦前100家资助型基金会中，子宫内膜异位症研究仅获得173,958欧元，而糖尿病获得254,908,430欧元、炎症性肠病获得325,940欧元，媒体提及量也相差悬殊。
Google DeepMind News 2026年9月30日
该工作提出并验证了 SynthID Bio 这一概念验证方案，用于对 AI 生成的蛋白质进行水印标记，同时在标记后保持蛋白质的生物学功能。
该工作提出并验证了 SynthID Bio 这一概念验证方案，用于对 AI 生成的蛋白质进行水印标记，同时在标记后保持蛋白质的生物学功能。
SynthID Bio 概念验证：为 AI 生成的蛋白质加入水印并保持其生物功能
该工作提出并验证了 SynthID Bio 这一概念验证方案，用于对 AI 生成的蛋白质进行水印标记，同时在标记后保持蛋白质的生物学功能。
该工作提出并验证了 SynthID Bio 这一概念验证方案，用于对 AI 生成的蛋白质进行水印标记，同时在标记后保持蛋白质的生物学功能。
Statistica Sinica 2026年9月30日
作者提出Delaunay加权两样本检验：在低维流形假设下用Delaunay三角剖分定义同时包含测地距离与相对方向的Delaunay权重，以组内Delaunay权重均值作为检验统计量并用置换法计算p值，理论上证明原假设下渐近正态、备择假设下相合，模拟显示在两分布协方差主方向不同时功效显著优于k-NN、k-MST、核检验、e-distance、协方差检验与回归检验，并在小鼠蛋白表达数据上以p=0.011检出药物治疗组差异。
作者提出Delaunay加权两样本检验：在低维流形假设下用Delaunay三角剖分定义同时包含测地距离与相对方向的Delaunay权重，以组内Delaunay权重均值作为检验统计量并用置换法计算p值，理论上证明原假设下渐近正态、备择假设下相合，模拟显示在两分布协方差主方向不同时功效显著优于k-NN、k-MST、核检验、e-distance、协方差检验与回归检验，并在小鼠蛋白表达数据上以p=0.011检出药物治疗组差异。
Delaunay加权两样本检验：利用几何方向信息在高维流形数据上检测协方差主方向差异
作者提出Delaunay加权两样本检验：在低维流形假设下用Delaunay三角剖分定义同时包含测地距离与相对方向的Delaunay权重，以组内Delaunay权重均值作为检验统计量并用置换法计算p值，理论上证明原假设下渐近正态、备择假设下相合，模拟显示在两分布协方差主方向不同时功效显著优于k-NN、k-MST、核检验、e-distance、协方差检验与回归检验，并在小鼠蛋白表达数据上以p=0.011检出药物治疗组差异。
作者提出Delaunay加权两样本检验：在低维流形假设下用Delaunay三角剖分定义同时包含测地距离与相对方向的Delaunay权重，以组内Delaunay权重均值作为检验统计量并用置换法计算p值，理论上证明原假设下渐近正态、备择假设下相合，模拟显示在两分布协方差主方向不同时功效显著优于k-NN、k-MST、核检验、e-distance、协方差检验与回归检验，并在小鼠蛋白表达数据上以p=0.011检出药物治疗组差异。
The FASEB Journal 2026年9月30日
该研究整合血浆代谢组学、孟德尔随机化与机器学习，在55种血浆代谢物中确认苯丙氨酸与胰腺癌存在因果关联（IVW OR=1.641，95% CI 1.052–2.562，p=0.029），据此筛选出8个相关差异基因并用12种算法共113种组合构建随机森林诊断模型（训练集AUC 0.994，三个外部验证集AUC 0.918、0.983、0.923），再以SHAP锁定SLC6A14为核心基因，通过单细胞测序、模拟基因敲除、分子对接与动力学模拟提示染料木素（genistein）可稳定结合SLC6A14，并在BxPC-3与HPDE6-C7细胞对中用RT-qPCR验证了5个建模基因的高表达。
该研究整合血浆代谢组学、孟德尔随机化与机器学习，在55种血浆代谢物中确认苯丙氨酸与胰腺癌存在因果关联（IVW OR=1.641，95% CI 1.052–2.562，p=0.029），据此筛选出8个相关差异基因并用12种算法共113种组合构建随机森林诊断模型（训练集AUC 0.994，三个外部验证集AUC 0.918、0.983、0.923），再以SHAP锁定SLC6A14为核心基因，通过单细胞测序、模拟基因敲除、分子对接与动力学模拟提示染料木素（genistein）可稳定结合SLC6A14，并在BxPC-3与HPDE6-C7细胞对中用RT-qPCR验证了5个建模基因的高表达。
整合代谢组学、孟德尔随机化与机器学习，研究锁定苯丙氨酸及其转运体SLC6A14作为胰腺癌诊断与治疗候选靶点
该研究整合血浆代谢组学、孟德尔随机化与机器学习，在55种血浆代谢物中确认苯丙氨酸与胰腺癌存在因果关联（IVW OR=1.641，95% CI 1.052–2.562，p=0.029），据此筛选出8个相关差异基因并用12种算法共113种组合构建随机森林诊断模型（训练集AUC 0.994，三个外部验证集AUC 0.918、0.983、0.923），再以SHAP锁定SLC6A14为核心基因，通过单细胞测序、模拟基因敲除、分子对接与动力学模拟提示染料木素（genistein）可稳定结合SLC6A14，并在BxPC-3与HPDE6-C7细胞对中用RT-qPCR验证了5个建模基因的高表达。
该研究整合血浆代谢组学、孟德尔随机化与机器学习，在55种血浆代谢物中确认苯丙氨酸与胰腺癌存在因果关联（IVW OR=1.641，95% CI 1.052–2.562，p=0.029），据此筛选出8个相关差异基因并用12种算法共113种组合构建随机森林诊断模型（训练集AUC 0.994，三个外部验证集AUC 0.918、0.983、0.923），再以SHAP锁定SLC6A14为核心基因，通过单细胞测序、模拟基因敲除、分子对接与动力学模拟提示染料木素（genistein）可稳定结合SLC6A14，并在BxPC-3与HPDE6-C7细胞对中用RT-qPCR验证了5个建模基因的高表达。
The FASEB Journal 2026年9月30日
该研究整合limma差异分析、WGCNA、GeneCards氧化应激基因集、PPI网络与LASSO、随机森林、SVM-RFE三种机器学习方法，从阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）脂肪组织转录组中筛出57个共有差异基因并锁定JAK2与ANXA5两个核心基因，随后用单细胞测序、scTenifoldKnk虚拟敲除、免疫浸润解卷积以及RT-qPCR和Western blot临床样本验证，发现JAK2在OSA中显著上调、ANXA5显著下调，二者主要富集于单核细胞，且CPAP治疗后JAK2下降、ANXA5回升。
该研究整合limma差异分析、WGCNA、GeneCards氧化应激基因集、PPI网络与LASSO、随机森林、SVM-RFE三种机器学习方法，从阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）脂肪组织转录组中筛出57个共有差异基因并锁定JAK2与ANXA5两个核心基因，随后用单细胞测序、scTenifoldKnk虚拟敲除、免疫浸润解卷积以及RT-qPCR和Western blot临床样本验证，发现JAK2在OSA中显著上调、ANXA5显著下调，二者主要富集于单核细胞，且CPAP治疗后JAK2下降、ANXA5回升。
整合机器学习与多层转录组分析将JAK2和ANXA5锁定为连接阻塞性睡眠呼吸暂停与氧化应激的关键基因，并在患者脂肪组织、间歇缺氧小鼠和CPAP治疗后样本中得到验证
该研究整合limma差异分析、WGCNA、GeneCards氧化应激基因集、PPI网络与LASSO、随机森林、SVM-RFE三种机器学习方法，从阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）脂肪组织转录组中筛出57个共有差异基因并锁定JAK2与ANXA5两个核心基因，随后用单细胞测序、scTenifoldKnk虚拟敲除、免疫浸润解卷积以及RT-qPCR和Western blot临床样本验证，发现JAK2在OSA中显著上调、ANXA5显著下调，二者主要富集于单核细胞，且CPAP治疗后JAK2下降、ANXA5回升。
该研究整合limma差异分析、WGCNA、GeneCards氧化应激基因集、PPI网络与LASSO、随机森林、SVM-RFE三种机器学习方法，从阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）脂肪组织转录组中筛出57个共有差异基因并锁定JAK2与ANXA5两个核心基因，随后用单细胞测序、scTenifoldKnk虚拟敲除、免疫浸润解卷积以及RT-qPCR和Western blot临床样本验证，发现JAK2在OSA中显著上调、ANXA5显著下调，二者主要富集于单核细胞，且CPAP治疗后JAK2下降、ANXA5回升。
bioRxiv 2026年9月30日
该研究在五个生物与人工序列的二分类任务上刻画了核苷酸级基础基因组语言模型 Evo 2 的上下文学习工作区间，发现短自然序列上表现稳健（miRNA 的 F1=0.902，毒素为 0.785），随序列长度增加而退化并在千碱基尺度崩溃，模型规模扩大无收益（7B 系统性优于 40B），困惑度难以预测准确率，并通过 logit-lens 与 Jacobian Scope 的机制可解释性分析提示存在预测—泛化权衡、模型可能追踪提示结构而非承载信号的序列内容。
该研究在五个生物与人工序列的二分类任务上刻画了核苷酸级基础基因组语言模型 Evo 2 的上下文学习工作区间，发现短自然序列上表现稳健（miRNA 的 F1=0.902，毒素为 0.785），随序列长度增加而退化并在千碱基尺度崩溃，模型规模扩大无收益（7B 系统性优于 40B），困惑度难以预测准确率，并通过 logit-lens 与 Jacobian Scope 的机制可解释性分析提示存在预测—泛化权衡、模型可能追踪提示结构而非承载信号的序列内容。
Evo 2 在五个二分类任务上展现上下文学习能力，短序列 F1 达 0.902，但千碱基尺度崩溃且 7B 反超 40B
该研究在五个生物与人工序列的二分类任务上刻画了核苷酸级基础基因组语言模型 Evo 2 的上下文学习工作区间，发现短自然序列上表现稳健（miRNA 的 F1=0.902，毒素为 0.785），随序列长度增加而退化并在千碱基尺度崩溃，模型规模扩大无收益（7B 系统性优于 40B），困惑度难以预测准确率，并通过 logit-lens 与 Jacobian Scope 的机制可解释性分析提示存在预测—泛化权衡、模型可能追踪提示结构而非承载信号的序列内容。
该研究在五个生物与人工序列的二分类任务上刻画了核苷酸级基础基因组语言模型 Evo 2 的上下文学习工作区间，发现短自然序列上表现稳健（miRNA 的 F1=0.902，毒素为 0.785），随序列长度增加而退化并在千碱基尺度崩溃，模型规模扩大无收益（7B 系统性优于 40B），困惑度难以预测准确率，并通过 logit-lens 与 Jacobian Scope 的机制可解释性分析提示存在预测—泛化权衡、模型可能追踪提示结构而非承载信号的序列内容。

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