Bloom只用30万细胞学脑细胞表征:跨RNA与染色质开放度,线性分类达91%–94%
艾伦脑科学研究所与AWS团队发布单细胞多模态模型Bloom,它把基因表达与染色质开放度统一编码为同一种细胞表征,训练细胞数比同类预训练模型少约100倍。在成年小鼠全脑数据上,基于Bloom表征的线性分类器对亚类判别的交叉验证调整平衡准确率为91%(多组学,315个亚类)、94%(scRNA-seq,310个亚类)和94%(snRNA-seq,297个亚类),且模型只见过小鼠多组学数据。
艾伦脑科学研究所与AWS团队发布单细胞多模态模型Bloom,它把基因表达与染色质开放度统一编码为同一种细胞表征,训练细胞数比同类预训练模型少约100倍。在成年小鼠全脑数据上,基于Bloom表征的线性分类器对亚类判别的交叉验证调整平衡准确率为91%(多组学,315个亚类)、94%(scRNA-seq,310个亚类)和94%(snRNA-seq,297个亚类),且模型只见过小鼠多组学数据。
脑电基础模型在冻结特征迁移上表现不稳,SeeEEG换了个思路:把脑电按临床浏览器的蒙太奇、滤波和对比度设置渲染成图像,只训练这套显示参数,视觉主干全程冻结。以冻结的DINOv3 ViT-B为编码器,SeeEEG在八个临床、睡眠、情感与脑机接口数据集的平衡准确率上全部超过七个脑电基础模型,按Cohen或AUROC排名的平均名次为1.3,最强基线REVE为2.9。
在目标细胞系没有药物测量数据时,GRAFT把该细胞系的基因扰动响应与源细胞的药物响应联系起来,预测药物引起的转录变化。在五株LINCS癌细胞系留一交叉验证中,GRAFT-D0的Top20 Pearson相关均值为0.734,高于源均值0.493和最强对照PRnet的0.689;在五个外部细胞环境中,等权平均Top20相关为0.606,源均值为0.416。方法依赖目标基因响应相对源参考的差异构成的条件状态,当目标基因测量很少时预测仍可改善,但增益随数据质量与来源覆盖变化。
一项覆盖文本、视觉、音频三种模态的混合专家预训练研究,用268次实验拟合出数据配比规律,并给出可操作的分配结论:音频更该把算力花在参数上,视觉和音频数据重复超过两遍收益很小,视觉对音频的干扰最强。
作者在统一多模态模型 BAGEL 上构建成对的图像到图像(I2I)生成与图像到文本(I2T)理解任务,发现以 I2I 训练更新共享参数、再做 I2T 微调的配方能随 I2I 数据增加而稳定提升理解表现,并据此建立覆盖 19 个 I2I 任务与 25 项理解能力的 OmniTaskonomy 分类体系,绘制出选择性、任务依赖的生成到理解迁移图,同时发现生成与理解梯度对齐更强之处对应更大的下游迁移增益。
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