# 变异优先级排序

超增强子此前只能靠H3K27ac等表观组学峰拼接来界定，未做过表观谱的细胞状态难以发现，其序列语法也无从解读。Borzoi-SE把超增强子识别改写为从524 kb长序列出发、按细胞类型分辨的基因组目标检测，在90种人类细胞与组织谱系上同时给出超增强子概率与边界。在留出染色体上，它的区域级PR-AUC为0.643、F1为0.498，而四个片段级基线分别约为0.34和0.15；对β-珠蛋白超增强子做计算机模拟删除，模型把HS2列为首要功能枢纽，CRISPRi沉默HS2后整个位点染色质可及性下降35%至85%。

超增强子此前只能靠H3K27ac等表观组学峰拼接来界定，未做过表观谱的细胞状态难以发现，其序列语法也无从解读。Borzoi-SE把超增强子识别改写为从524 kb长序列出发、按细胞类型分辨的基因组目标检测，在90种人类细胞与组织谱系上同时给出超增强子概率与边界。在留出染色体上，它的区域级PR-AUC为0.643、F1为0.498，而四个片段级基线分别约为0.34和0.15；对β-珠蛋白超增强子做计算机模拟删除，模型把HS2列为首要功能枢纽，CRISPRi沉默HS2后整个位点染色质可及性下降35%至85%。

单基因糖尿病基因中大量变异因证据不足被归为意义未明变异，ClinVar 里长期积压。一项分析用 22 个相关基因的 7706 个已明确分类单核苷酸变异训练可解释分类器，在 771 个留出变异上取得 ROC-AUC 0.9989、AUPRC 0.9970，并对致病类召回 1.00。特征消融显示高分部分来自特征与 ACMG 判读标准的重叠，但在无法直接援引计算证据的非错义变异上仍以 99.0% 对 87.0% 超过多数类基线，随后对 6306 个意义未明变异给出逐变异解释的排序。

单基因糖尿病基因中大量变异因证据不足被归为意义未明变异，ClinVar 里长期积压。一项分析用 22 个相关基因的 7706 个已明确分类单核苷酸变异训练可解释分类器，在 771 个留出变异上取得 ROC-AUC 0.9989、AUPRC 0.9970，并对致病类召回 1.00。特征消融显示高分部分来自特征与 ACMG 判读标准的重叠，但在无法直接援引计算证据的非错义变异上仍以 99.0% 对 87.0% 超过多数类基线，随后对 6306 个意义未明变异给出逐变异解释的排序。