AbbVie (United States)

PharmaDiff把三维药效团假设转成原子级子图，作为条件注入扩散生成过程，直接产出符合预设空间排布的三维分子。在GEOM-Drugs测试集随机抽取的250个药效团条件上，其平均匹配分数为0.8964、完美匹配率为0.6990，高于PGMG、TransPharmer、REINVENT4、ShEPhERD与PhoreGen；在四个靶点上平均对接分数也优于需要蛋白结构的DiffSBDD，但PoseBusters通过率低于ShEPhERD与PhoreGen。

PharmaDiff把三维药效团假设转成原子级子图，作为条件注入扩散生成过程，直接产出符合预设空间排布的三维分子。在GEOM-Drugs测试集随机抽取的250个药效团条件上，其平均匹配分数为0.8964、完美匹配率为0.6990，高于PGMG、TransPharmer、REINVENT4、ShEPhERD与PhoreGen；在四个靶点上平均对接分数也优于需要蛋白结构的DiffSBDD，但PoseBusters通过率低于ShEPhERD与PhoreGen。

分子晶体多晶型的热力学排序长期依赖爱因斯坦晶体法（ECM），后者要为每个多晶型单独采样一串重叠的炼金中间态，成本随晶型景观扩大而难以承受。该工作把靶向自由能微扰中的映射交给归一化流学习：模型把分子动力学采到的超胞构型可逆地变换到解析参考分布，再用靶向Bennett接受率（tBAR）重加权得到晶格自由能。在琥珀酸、Veliparib和Mivebresib上，结果与ECM吻合，可处理约3×10³自由度的超胞，平均计算时间约为ECM的2.5分之一。

分子晶体多晶型的热力学排序长期依赖爱因斯坦晶体法（ECM），后者要为每个多晶型单独采样一串重叠的炼金中间态，成本随晶型景观扩大而难以承受。该工作把靶向自由能微扰中的映射交给归一化流学习：模型把分子动力学采到的超胞构型可逆地变换到解析参考分布，再用靶向Bennett接受率（tBAR）重加权得到晶格自由能。在琥珀酸、Veliparib和Mivebresib上，结果与ECM吻合，可处理约3×10³自由度的超胞，平均计算时间约为ECM的2.5分之一。