药效团直接约束三维扩散生成：PharmaDiff 不靠靶点结构，完美匹配率0.6990
PharmaDiff把三维药效团假设转成原子级子图，作为条件注入扩散生成过程，直接产出符合预设空间排布的三维分子。在GEOM-Drugs测试集随机抽取的250个药效团条件上，其平均匹配分数为0.8964、完美匹配率为0.6990，高于PGMG、TransPharmer、REINVENT4、ShEPhERD与PhoreGen；在四个靶点上平均对接分数也优于需要蛋白结构的DiffSBDD，但PoseBusters通过率低于ShEPhERD与PhoreGen。