标准流程判为PTEN野生型的样本里,模型又找出33例缺失,其中75%染色证实蛋白丢失
德累斯顿大学肿瘤中心在MASTERsg精准肿瘤项目中用梯度提升模型重读TSO500 panel测序的拷贝数原始分箱数据,专门找被标准流程漏掉的PTEN局灶缺失。TSO500按基因内分箱读数取平均,局灶事件达不到倍数变化阈值;模型在204例被判为PTEN野生型的样本中报出33例缺失,其中20例有组织可染色,15例显示PTEN蛋白缺失或明显降低。
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德累斯顿大学肿瘤中心在MASTERsg精准肿瘤项目中用梯度提升模型重读TSO500 panel测序的拷贝数原始分箱数据,专门找被标准流程漏掉的PTEN局灶缺失。TSO500按基因内分箱读数取平均,局灶事件达不到倍数变化阈值;模型在204例被判为PTEN野生型的样本中报出33例缺失,其中20例有组织可染色,15例显示PTEN蛋白缺失或明显降低。
该研究用重组金黄色葡萄球菌丝氨酸蛋白酶样蛋白B(SplB)或失活突变体反复气管内接种小鼠,发现SplB可致敏小鼠并引起嗜酸性气道炎症与气道高反应性,且该过程依赖SplB的蛋白水解活性和功能性适应性免疫系统,其中可溶性蛋白酶感受器IL-33为嗜酸性粒细胞组织浸润所必需,而膜结合蛋白酶感受器PAR2并非必需,据此作者提出金黄色葡萄球菌可通过释放SplB等过敏原致敏个体并导致哮喘发生的第三种机制。
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