标准流程判为PTEN野生型的样本里,模型又找出33例缺失,其中75%染色证实蛋白丢失
德累斯顿大学肿瘤中心在MASTERsg精准肿瘤项目中用梯度提升模型重读TSO500 panel测序的拷贝数原始分箱数据,专门找被标准流程漏掉的PTEN局灶缺失。TSO500按基因内分箱读数取平均,局灶事件达不到倍数变化阈值;模型在204例被判为PTEN野生型的样本中报出33例缺失,其中20例有组织可染色,15例显示PTEN蛋白缺失或明显降低。
2 篇关联报道
德累斯顿大学肿瘤中心在MASTERsg精准肿瘤项目中用梯度提升模型重读TSO500 panel测序的拷贝数原始分箱数据,专门找被标准流程漏掉的PTEN局灶缺失。TSO500按基因内分箱读数取平均,局灶事件达不到倍数变化阈值;模型在204例被判为PTEN野生型的样本中报出33例缺失,其中20例有组织可染色,15例显示PTEN蛋白缺失或明显降低。
该工作提出ICARus——一个正例-未标注(positive-unlabelled)读出精炼框架,将蛋白质语言模型推导的蛋白质-蛋白质互作信息整合进全基因组RNA干扰筛选,以提升痘苗病毒-宿主互作及潜在抗病毒人类基因的发现,并将该筛选的原始与精炼读出作为面向智能体AI的社区资源公开。
已读完全部报道