甲基化测序也能读出片段组:血浆cfDNA直接划出共甲基化区块,癌症检测多一层可解释信号
血浆游离DNA的甲基化测序原本只用来读甲基化,现在被证明还能部分保留片段长度与末端基序等片段组信号。研究在血浆cfDNA中直接划分共甲基化区块,把甲基化与片段组特征放进同一批基因组区间,并据此构建可解释的集成模型用于癌症检测与组织来源预测。跨平台比较显示主要片段组模式在甲基化测序中得以重现,但保留程度因特征而异。
2 篇关联报道
血浆游离DNA的甲基化测序原本只用来读甲基化,现在被证明还能部分保留片段长度与末端基序等片段组信号。研究在血浆cfDNA中直接划分共甲基化区块,把甲基化与片段组特征放进同一批基因组区间,并据此构建可解释的集成模型用于癌症检测与组织来源预测。跨平台比较显示主要片段组模式在甲基化测序中得以重现,但保留程度因特征而异。
该工作构建了PlantRegMoD,一个面向植物再生的AI驱动整合型多组学数据库,整合了来自147个项目、32个物种、2,593个样本的20.54 TB标准化多组学数据,建立了涵盖五大类、九种再生模型的统一层级分类体系,整理了236个再生基因及其在58个代表性植物物种中的28,190个同源基因,并包含196,423个单细胞和超过881万个表观遗传峰,配备九个在线组学工具和基于RAG的智能问答系统。
已读完全部报道