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# 生化网络重连

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  1. arXiv

    生化网络重连不必先有完整模型:30个标志物压到10维,目标轨迹精度与全量神经ODE相当

    Co2ODE把每个细胞语境下承载信号的那部分网络单独建模:条件掩码挑出与重连相关的标志物,其余标志物由变分自编码器压成一个闭包项,与稀疏ODE联合训练。在覆盖30种癌症相关过表达的单细胞磷酸化蛋白数据上,它把30个标志物压成10维状态,目标轨迹精度与用全量标志物拟合的神经ODE相当;但加入先验评分后,被选中的标志物会整体移动而拟合几乎不变,说明这批数据不足以唯一确定真实的重连结构。

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