# 分子对接

该研究以网络药理学预测丹皮酚与玫瑰痤疮的共同靶点，并在LL-37诱导的玫瑰痤疮样BALB/c小鼠模型中验证：150 mg/kg丹皮酚显著降低红斑面积与评分、减轻炎症细胞与CD4+ T细胞浸润及血管生成，同时下调S100A9与p65磷酸化，提示其疗效与S100A9-NF-κB信号受抑相关。

该研究以网络药理学预测丹皮酚与玫瑰痤疮的共同靶点，并在LL-37诱导的玫瑰痤疮样BALB/c小鼠模型中验证：150 mg/kg丹皮酚显著降低红斑面积与评分、减轻炎症细胞与CD4+ T细胞浸润及血管生成，同时下调S100A9与p65磷酸化，提示其疗效与S100A9-NF-κB信号受抑相关。

这篇综述系统汇总了吲哚类小分子作为抗结核候选物、靶向分枝菌酸生物合成通路（MmpL3、InhA、KasA/KasB）的设计、合成与生物学评价进展，逐系列列出最优化合物的MIC值（如MmpL3方向的化合物20-22为0.0195 µg/mL、化合物36a为0.024 µM、化合物82的MIC50为0.015 µM；InhA方向的化合物122a为0.39 µM、化合物143f为3.99 µM）与分子对接结果，并指出许多吲哚系列尚缺乏纯化酶IC50/Ki等直接生化抑制数据和耐药突变、靶点过表达等遗传学验证。

这篇综述系统汇总了吲哚类小分子作为抗结核候选物、靶向分枝菌酸生物合成通路（MmpL3、InhA、KasA/KasB）的设计、合成与生物学评价进展，逐系列列出最优化合物的MIC值（如MmpL3方向的化合物20-22为0.0195 µg/mL、化合物36a为0.024 µM、化合物82的MIC50为0.015 µM；InhA方向的化合物122a为0.39 µM、化合物143f为3.99 µM）与分子对接结果，并指出许多吲哚系列尚缺乏纯化酶IC50/Ki等直接生化抑制数据和耐药突变、靶点过表达等遗传学验证。

该工作通过在约50万条来自ChEMBL数据库的分子数据上微调GPT-2模型，并与在同一数据集上训练的LSTM网络进行基准对比，生成新的EGFR抑制剂候选分子，对生成化合物进行有效性、独特性与新颖性评估，再经Lipinski五规则、合成可及性与类药性评分过滤，并对入选候选物针对EGFR（PDB ID: 1M17）开展分子对接以评估结合亲和力，结果显示GPT-2在生成结构多样分子方面表现突出，而LSTM生成的化学有效分子比例更高，许多候选物与EGFR表现出良好结合相互作用。

该工作通过在约50万条来自ChEMBL数据库的分子数据上微调GPT-2模型，并与在同一数据集上训练的LSTM网络进行基准对比，生成新的EGFR抑制剂候选分子，对生成化合物进行有效性、独特性与新颖性评估，再经Lipinski五规则、合成可及性与类药性评分过滤，并对入选候选物针对EGFR（PDB ID: 1M17）开展分子对接以评估结合亲和力，结果显示GPT-2在生成结构多样分子方面表现突出，而LSTM生成的化学有效分子比例更高，许多候选物与EGFR表现出良好结合相互作用。