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# 从头结合蛋白设计

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  1. bioRxiv

    深度学习设计的小蛋白Denasin1在小鼠卒中模型把梗死体积从19.5%降到8.6%

    酸敏感离子通道hASIC1a在缺血时被持续激活并推动神经元死亡,但小分子抑制剂缺乏选择性或效力,毒液肽则受pH依赖性和二硫键生产限制。研究者用RFdiffusion生成骨架、ProteinMPNN分配序列、AlphaFold2筛选,从约1.2万个骨架和7万个序列中选出76个候选,经自动膜片钳筛出44氨基酸的Denasin1。该小蛋白在溶液中无序,结合后折叠为螺旋-转角-螺旋,对hASIC1a的IC50为23±2.5 nM,并在小鼠短暂性大脑中动脉闭塞模型中把梗死体积从19.5±9%降至8.6±5.4%。

  2. 智能体走进湿实验室:闭环三轮设计,把α-凝血酶结合率从0%推到42.1%

    Google Research 把 AI 智能体接到湿实验室的液体处理机器人上,让设计、实验、测序读回构成闭环。此前智能体只能做计算设计,真实实验读数是瓶颈。以 DNA 适配体为试验场,两轮失败后智能体自行改规则,α-凝血酶确认命中率从首轮 0% 升到 42.1%,肌红蛋白达 33.5%。

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