尿液代谢物不用标签也能分出癌症:四代谢物面板在八种癌上保留九成监督学习判别力
一个四代谢物尿液与血浆面板在八种癌症中把病例与对照分开,且一个全程不使用结局标签的模型仍达到AUC 0.925,接近监督学习的0.991。
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一个四代谢物尿液与血浆面板在八种癌症中把病例与对照分开,且一个全程不使用结局标签的模型仍达到AUC 0.925,接近监督学习的0.991。
一个由41位国际多学科专家组成的工作组系统检索了截至2025年3月17日的922篇文献,将2016年仅针对特发性肺纤维化(IPF)的急性加重(AE)定义修订为适用于全部纤维化间质性肺病(fILD)的AE-fILD定义(以弥漫性肺泡损伤为核心,伴或不伴机化性肺炎),并提出“急性呼吸恶化(ARW)”这一更广的概念框架以涵盖非DAD所致的急性呼吸恶化,同时汇总了流行病学、危险因素、预后与治疗证据,并讨论了AE作为临床试验终点的可行性。
该研究用LLM引导的可解释决策树DEFT从HCT116细胞的eNET-seq数据中发现暂停位点由暂停位的G、+1位C/T与上游49个碱基的最小G含量共同决定(留出集AUROC 0.92、准确率0.87),并据此在NDRG1和HSP90AA1的5'端插入377 bp无G序列,以方向依赖方式消除启动子近端暂停(PPP),而低氧与热激激活未受损(NDRG1反而超激活);同时ChIP的5' RNAPII、Ser5P与NELF峰在无NET-seq暂停时仍然存在,CTD缺失则削弱PPP并把暂停峰由约+80位移至约+40,据此提出PPP由G依赖的停滞启动、并由包括CTD系连在内的多因素稳定。
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