酶与反应配对不再只靠序列相似:RIVER 用多智能体汇总证据,在 667 个候选蛋白中把四个目标酶全部排进前列
RIVER 是一个无需训练的多智能体检索框架,把大语言模型、生化计算工具和外部知识库组织成可追溯的证据链,用于酶到反应和反应到酶的双向检索。在来自大肠杆菌代谢组学文献的四个实验支持的酶—反应案例中,它需要在 667 个候选蛋白里排序,使用 Qwen3.6-35B-A3B 时平均倒数排名为 0.833,使用 GPT-5.6 Luna 时为 0.750,均高于表中列出的通用编码智能体组合与领域方法。在公开基准上,它在 Enzyme-405 上的 Top-1 查询成功率为 82.3%,在 Orphan-335 上为 72.8%。