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# 蛋白质构象集合生成

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  1. arXiv

    蛋白质构象集合生成改走集体模式:CoMoFlow把协调运动显式建模,还能按方向调

    蛋白质构象集合生成此前把残基间的协调运动隐含在学到的分布里,难以直接控制。CoMoFlow从平衡结构构造蛋白特异的集体模式,学习这些模式系数在分子动力学集合中的分布,再用采样得到的集体位移通过特征条件化和平移先验重定心引导SE(3)流匹配。在ATLAS与从头设计蛋白两个基准上,它相对BBFlow把DCCM相关从0.87/0.83提高到0.93/0.89、PCA距离从1.33/0.67降到1.21/0.59,并支持沿选定模式按方向和幅度调节生成构象。

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