# 潜在细胞状态模型

单细胞RNA测序在测量时破坏细胞，且只在离散时间点采样，因此同一细胞的表达谱无法被连续追踪。Latent Cell-State Model把细胞状态转移近似为马尔可夫链，并引入一个低维连续潜变量，在给定细胞状态、时间与基因的条件下生成表达计数。在胰腺发育与Waddington-OT重编程两个数据集上，该模型对留出时间点生成样本与真实样本的最大均值差异分别为0.011和0.006（胰腺第3天、第6天）以及0.030和0.018（重编程第3.5天、第4天），低于所比较的三种方法。

单细胞RNA测序在测量时破坏细胞，且只在离散时间点采样，因此同一细胞的表达谱无法被连续追踪。Latent Cell-State Model把细胞状态转移近似为马尔可夫链，并引入一个低维连续潜变量，在给定细胞状态、时间与基因的条件下生成表达计数。在胰腺发育与Waddington-OT重编程两个数据集上，该模型对留出时间点生成样本与真实样本的最大均值差异分别为0.011和0.006（胰腺第3天、第6天）以及0.030和0.018（重编程第3.5天、第4天），低于所比较的三种方法。