细胞形态图谱不再依赖分割:自监督模型在跨实验室检索中比CellProfiler多找回约三成机制类别
细胞形态图谱过去依赖细胞分割和人工特征,标注稀缺又难跨实验室复用。研究者在JUMP–CP的119,876个无标注化合物、约177万张图像上预训练四类自监督模型,冻结权重后直接提取图像嵌入。在EU-OPENSCREEN Bioactives的2,464个化合物上,DINO与DINOv2在作用机制检索的位点平均mAP上比CellProfiler高31–37%,并全面优于掩码类模型。
细胞形态图谱过去依赖细胞分割和人工特征,标注稀缺又难跨实验室复用。研究者在JUMP–CP的119,876个无标注化合物、约177万张图像上预训练四类自监督模型,冻结权重后直接提取图像嵌入。在EU-OPENSCREEN Bioactives的2,464个化合物上,DINO与DINOv2在作用机制检索的位点平均mAP上比CellProfiler高31–37%,并全面优于掩码类模型。
胶质瘤拉曼光谱数据中,单条光谱足以让模型认出它来自哪位病人,这种与生物学无关的样本特异性偏差会干扰肿瘤分型。研究在APOLLO数据集的46例样本上引入可学习特征重要性层,与双头分类器对抗训练,压低病人身份信号而保留IDH突变状态信息。身份预测平衡准确率从68%降到12%,突变型与野生型分类的平衡准确率保持在0.8。
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