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# 虚拟胚胎建模

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  1. bioRxiv

    BLOOM把稀疏发育图谱变成可查询的虚拟胚胎:三个小鼠图谱上基因与细胞相关性均排第一

    BLOOM把转录组虚拟胚胎建模写成条件生成问题:给定一段已观测的细胞群体历史、目标发育阶段和细胞状态信息,生成该阶段的表达分布。它用伪轨迹连接独立采样的细胞群体,并把发育年龄、细胞身份层级、解剖背景、基因程序和转录因子–靶标网络作为条件,同时约束高斯基分布与流匹配生成器。在产前、视觉皮层和多器官内皮三个小鼠单细胞图谱上,与22个时间序列预测基线相比,BLOOM在三个数据集的阶段平均基因相关性和细胞相关性上都排第一。

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