# 定量构效关系建模

含非天然氨基酸的肽把可设计空间推到10⁵⁰量级，穷举筛选已不可行。PepOpt把每个残基编码成位置特异的分子指纹，用线性回归预测活性，再用动态规划在加法假设下确定性地找出全局最优序列。在11个内部肽系列上，它的预测与非线性模型相当或更好，并在10²⁰与10⁵⁰两个空间中给出比遗传算法更高的预测分数。

含非天然氨基酸的肽把可设计空间推到10⁵⁰量级，穷举筛选已不可行。PepOpt把每个残基编码成位置特异的分子指纹，用线性回归预测活性，再用动态规划在加法假设下确定性地找出全局最优序列。在11个内部肽系列上，它的预测与非线性模型相当或更好，并在10²⁰与10⁵⁰两个空间中给出比遗传算法更高的预测分数。