跳到主要内容
检索

# 内在无序蛋白

2 篇关联报道

订阅更新
  1. bioRxiv

    bAIes 不再只依赖 AlphaFold2：换用六种结构预测器，无序蛋白原子级构象集合精度相当

    bAIes 原本只从 AlphaFold2 的距离分布图提取结构信息，用来生成无序蛋白的原子级构象集合。现在它接入 AlphaFold2、AlphaFold3、Boltz-1、Boltz-2、ESMFold 和 ESMFold2 六种预测器，并在 17 个无序蛋白的 NMR 与 SAXS 数据上比较。各预测器给出的集合平均精度与原 AlphaFold2 版本相当，对化学位移、RDC 和 3J 耦合等局部观测量最好，对 PRE 和 SAXS 这类长程与整体压缩观测量偏弱。

    Institut Pasteur
    Vincent Schnapka（第一作者）Massimiliano Bonomi（通讯作者）
    bAIes框架内在无序蛋白蛋白质结构预测分子动力学
  2. Nature Communications

    无序蛋白不再只靠重加权：扩散模型一次生成全原子构象，NMR与SAXS同时对上

    IDPForge把ESMFold的注意力与结构模块改造成扩散生成模型，直接从序列生成全原子无序蛋白与无序区构象，无需逐序列训练、粗粒化回映射或系综重加权。在32条带NMR/SAXS数据的测试序列上，其归一化X-EISD总分0.89，高于IDPConformerGenerator的0.57、IDPFold的0.58与CALVADOS的0.58；它还能在折叠结构模板上只对无序区去噪。

    University of California, BerkeleyUniversity of TorontoHospital for Sick Children
    Oufan Zhang（第一作者）Stefano De Castro（第一作者）Teresa Head‐Gordon（通讯作者）
    IDPForge扩散模型内在无序蛋白蛋白质结构预测

已读完全部报道