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# stMIND时空多尺度交互神经动力学模型

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  1. arXiv

    时空转录组快照不再对齐:stMIND把表达漂移拆成局部与非局部,锁定蝾螈脑再生10–15天转折

    时空转录组测序是破坏性的,每个时间点测到的是互不对应的细胞快照,中间轨迹和跨尺度细胞间相互作用因此看不到。stMIND把每个细胞的表达漂移拆成细胞内在程序、半径内基于相对表达差与空间几何的局部图差分算子、以及半径外按质量加权的非局部平均场注意力,并让邻域随细胞迁移共同演化。在蝾螈端脑再生与斑马鱼胚胎发生基准上,它取得最高的基因表达预测精度、解剖一致性与空间连贯性;消融显示局部与非局部算子缺一不可,并据此定位到损伤后10–15天的再生转折窗口。

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