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Animesh Acharjee

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  1. medRxiv

    IBDex把3,168份肠道活检冻成一张参照图谱:深度缓解压住炎症,却压不住疾病状态

    炎症性肠病的黏膜RNA测序长期按队列各自重建分子尺度,历史数据难以成为可复用的参照。IBDex用四个队列、1,680名患者的3,168份活检训练一个组织感知的条件变分自编码器,并以对抗方式压制队列身份,随后冻结基因接口、编码器、解码器、通路基与表型方向。冻结后在新队列中数据集身份平衡准确率降至0.307(随机为0.250),而炎症仍可判别(AUC 0.82);93名内镜与组织学一致缓解的患者炎症接近对照(AUC 0.58),疾病状态仍偏离(AUC 0.725)。

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