单细胞参考图谱换个锚点:标签方向先定死,查询细胞注释宏F1从0.774升到0.811
单细胞参考映射不再让类别代表随训练漂移。此前SCLSC用平均表达谱构造类型代表,代表位置在优化中不断变化;SOLAR在训练前给每个参考标签指定一个固定的正交方向,让编码器只学细胞落在该空间的哪里。在人类免疫、肺和胰腺三个数据集的九个留出批次上,30维输出的查询宏F1均值为0.811,高于匹配PCA的0.774,低于scANVI的0.838。
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单细胞参考映射不再让类别代表随训练漂移。此前SCLSC用平均表达谱构造类型代表,代表位置在优化中不断变化;SOLAR在训练前给每个参考标签指定一个固定的正交方向,让编码器只学细胞落在该空间的哪里。在人类免疫、肺和胰腺三个数据集的九个留出批次上,30维输出的查询宏F1均值为0.811,高于匹配PCA的0.774,低于scANVI的0.838。
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