Tiejun Li

时间序列空间转录组每次只测一张组织切片，细胞如何迁移、增殖、彼此影响只能间接推断。CytoBridge在转录组与空间坐标组成的联合状态空间里学习连续群体演化，把速度拆成由空间邻域和配体—受体先验估计的相互作用项与内在调控项，并允许细胞数增减。在五个数据集、三种空间转录组平台上，它生成未测量的中间阶段；留一阶段基准的33个组合中，它在12个上Sliced-W2最低，多于其他任何方法或对照。

时间序列空间转录组每次只测一张组织切片，细胞如何迁移、增殖、彼此影响只能间接推断。CytoBridge在转录组与空间坐标组成的联合状态空间里学习连续群体演化，把速度拆成由空间邻域和配体—受体先验估计的相互作用项与内在调控项，并允许细胞数增减。在五个数据集、三种空间转录组平台上，它生成未测量的中间阶段；留一阶段基准的33个组合中，它在12个上Sliced-W2最低，多于其他任何方法或对照。