Wen Li

在跨条件单细胞数据里，原有的基因级批次效应指标会把受刺激条件驱动的基因误判为高批次敏感基因。条件感知GTE在计算前先用scDisInFact把条件效应与批次效应拆开，为每个基因给出条件驱动分数，再按该分数对原指标做乘性惩罚。在8名供者、29,065个细胞的干扰素-β刺激PBMC数据上，惩罚指数取3时，18个已知干扰素刺激基因的平均排名位移达870.2，而核糖体对照基因仍保持在基线波动内。

在跨条件单细胞数据里，原有的基因级批次效应指标会把受刺激条件驱动的基因误判为高批次敏感基因。条件感知GTE在计算前先用scDisInFact把条件效应与批次效应拆开，为每个基因给出条件驱动分数，再按该分数对原指标做乘性惩罚。在8名供者、29,065个细胞的干扰素-β刺激PBMC数据上，惩罚指数取3时，18个已知干扰素刺激基因的平均排名位移达870.2，而核糖体对照基因仍保持在基线波动内。