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Nirjhor Datta

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  1. bioRxiv

    DNA语言模型换个读链就改答案:MirrorDNA把切分点做成镜像,两条链给出同一预测

    DNA语言模型通常只按一条链切词、训练和测试,同一段序列反向互补后预测会变。MirrorDNA用一个对称路由器让两条链在镜像位置切分,并证明整条模型对反向互补等变。在12个链对称的Nucleotide Transformer任务上,它两条链的MCC都是0.491,而NT-v2、DNABERT-2和HyenaDNA只有0.152、0.187和0.080。

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