Oncode Institute

该研究构建了 HARP（Human Cell Atlas Reference for PBMCs），整合来自 15 项研究、四大洲、超过 2600 名供者（从新生儿到 97 岁，涵盖健康与多种免疫相关疾病）的约 900 万个外周血单个核细胞（PBMC），开发了优化的整合流程与新的无标签整合质量评估指标，形成 192 种免疫细胞亚群的社区共识注释（含低至 0.004% 的稀有群体），揭示与年龄、性别和疾病相关的协调细胞模块、女性偏倚的干扰素与炎症基因程序及其在 COVID-19 中的扰动，以及前列腺素信号通路中此前未被描述的性别二态性，并提出分层标签迁移框架 scTiger，可将这 192 种注释准确投射到另外约 1800 万个 PBMC 上。

该研究构建了 HARP（Human Cell Atlas Reference for PBMCs），整合来自 15 项研究、四大洲、超过 2600 名供者（从新生儿到 97 岁，涵盖健康与多种免疫相关疾病）的约 900 万个外周血单个核细胞（PBMC），开发了优化的整合流程与新的无标签整合质量评估指标，形成 192 种免疫细胞亚群的社区共识注释（含低至 0.004% 的稀有群体），揭示与年龄、性别和疾病相关的协调细胞模块、女性偏倚的干扰素与炎症基因程序及其在 COVID-19 中的扰动，以及前列腺素信号通路中此前未被描述的性别二态性，并提出分层标签迁移框架 scTiger，可将这 192 种注释准确投射到另外约 1800 万个 PBMC 上。

该工作提出 AlphaBridge，一个结合 AlphaFold3 置信度指标、可对参与二元相互作用的序列基序及其在复合物三维界面中的分布进行聚类，并通过弦图、网络图和汇总表可视化置信范围内的相互作用界面、同时提供网页服务器版本的可复现自动化工具包，作者用二元与多组分蛋白复合物对其评分能力进行了验证并讨论了实际使用案例。

该工作提出 AlphaBridge，一个结合 AlphaFold3 置信度指标、可对参与二元相互作用的序列基序及其在复合物三维界面中的分布进行聚类，并通过弦图、网络图和汇总表可视化置信范围内的相互作用界面、同时提供网页服务器版本的可复现自动化工具包，作者用二元与多组分蛋白复合物对其评分能力进行了验证并讨论了实际使用案例。