肿瘤克隆不只看基因突变:调控网络把优势克隆与普通克隆分开,253例12种癌复现
肿瘤内部各克隆的基因调控网络能否从单细胞转录组中区分出来,此前克隆多按拷贝数划分、很少刻画其调控活动。研究者为每个克隆推断调控网络,用基于Wasserstein距离的调控分歧度比较克隆之间及克隆与正常细胞的差异。在253例、12种癌症的扩展队列中,克隆间网络比克隆与正常细胞更相似,且最大克隆偏离正常细胞的程度显著大于较小克隆。
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肿瘤内部各克隆的基因调控网络能否从单细胞转录组中区分出来,此前克隆多按拷贝数划分、很少刻画其调控活动。研究者为每个克隆推断调控网络,用基于Wasserstein距离的调控分歧度比较克隆之间及克隆与正常细胞的差异。在253例、12种癌症的扩展队列中,克隆间网络比克隆与正常细胞更相似,且最大克隆偏离正常细胞的程度显著大于较小克隆。
该工作把科学多智能体强化学习(SMARL)用于地球物理湍流的亚网格闭合建模:以从少量高保真样本估计的拟涡能谱为奖励,在线学习Leith模型系数,使分辨率比DNS粗160至163840倍的LES在长达训练数据约2000倍的模拟中稳定运行,并复现DNS的动能谱与涡量概率密度函数,包括代表极端事件的尾部。
该工作提出一条由大语言模型驱动的模块化智能体流水线,从科学文献的表格与正文中自动抽取并结构化混凝土材料的组成—工艺—性能属性,在17个开源与专有模型上取得最高0.98的F1分数,并在约一小时内从超过27,000篇文献筛选出的278篇论文中抽取逾10,000条记录,经后处理形成含近9,000条高质量记录、100余项属性的迄今最大公开掺合水泥混凝土实验室数据库,机器学习分析进一步显示大规模、多样且信息丰富的数据库可同时提升分布内精度与对未见材料体系的分布外泛化。
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