跳到主要内容
检索

# 马赛克整合

1 篇关联报道

订阅更新
  1. researchsquare.com

    单细胞多组学整合换了起点:不再重建分子测量,改从细胞相似关系里分解出共同表征

    单细胞多组学整合要在只有部分细胞同时测得RNA和染色质可及性的镶嵌设计下,把两类测量放进同一表征。Mosaic Cell Relation Factorization(MCRF)不再重建分子测量,而是先算出细胞之间的相似关系,再把这些关系分解成细胞因子和每种模态各自的权重矩阵,配对细胞在两种模态中共享同一套因子。在scMultiSim模拟数据上,MCRF在原始144个数据集的36个配置中有22个的NMI中位数高于UINMF、28个高于MIDAS,并在多个配置中跨模拟重复的波动更小;但在新增的102个更大数据集上,UINMF和MIDAS在全部24个四重复配置中的ARI中位数都更高。

已读完全部报道