# 非天然氨基酸肽设计

肽的逆折叠模型通常在每个位点只输出二十种天然残基的概率，想加入一个非天然残基就得备好该残基的结构数据并把模型整体重训一遍。AtomWeaver 换掉了这一步：它先在固定骨架和靶标蛋白的条件下把侧链当作三维空间里的原子堆出来，最后再拿成型原子云去比对参考残基模板库，读出这是哪种残基。在覆盖十二个蛋白靶标、353 条骨架的 PeptideArena 上，它的表现与只设计二十种残基的方法相当，把候选词汇扩到 300 种残基后仍落在同一区间。

肽的逆折叠模型通常在每个位点只输出二十种天然残基的概率，想加入一个非天然残基就得备好该残基的结构数据并把模型整体重训一遍。AtomWeaver 换掉了这一步：它先在固定骨架和靶标蛋白的条件下把侧链当作三维空间里的原子堆出来，最后再拿成型原子云去比对参考残基模板库，读出这是哪种残基。在覆盖十二个蛋白靶标、353 条骨架的 PeptideArena 上，它的表现与只设计二十种残基的方法相当，把候选词汇扩到 300 种残基后仍落在同一区间。