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# CellScribe

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  1. bioRxiv

    CellScribe把细胞身份与状态合进一个生成接口:在309类留出研究上宏F1达0.223,超过冻结嵌入探针

    单细胞注释长期把细胞身份(谱系)与状态(活跃转录程序)分开处理,固定输出头的分类器也只能给出预设类型。CellScribe用AdaLN适配器把冻结的单细胞基础模型嵌入接入预训练语言模型,让同一个模型按提示生成本体标注的细胞类型或带活性分数的元程序谱。在CELLxGENE的309类、444万细胞留出研究划分上,完整流程的宏F1为0.223、加权F1为0.484,均高于冻结scFoundation嵌入探针的0.194和0.366;在3CA留出研究的恶性细胞上,标志准确率为0.344,探针为0.227。

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