DNA甲基化读出细胞分化程度:不用转录组,也能看到衰老组织向间充质漂移
DNA甲基化数据此前缺少通用的分化状态量化方法,EpiDiff用1298个分化相关CpG训练随机森林,输出0到1的连续分化指数。它在独立数据集上分类准确率0.97,并在多种分选细胞中随年龄升高,其背后是许多细胞类型向中胚层方向的发育性表观漂移。
DNA甲基化数据此前缺少通用的分化状态量化方法,EpiDiff用1298个分化相关CpG训练随机森林,输出0到1的连续分化指数。它在独立数据集上分类准确率0.97,并在多种分选细胞中随年龄升高,其背后是许多细胞类型向中胚层方向的发育性表观漂移。
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