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# 嵌入扰动分析

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  1. bioRxiv

    橄榄短串联重复不再只当标记:三个植物基因组模型对同一批位点给出可重复的嵌入响应

    橄榄的短串联重复(STR,重复单元拷贝数可变的片段)此前主要靠少量微卫星标记来读,全基因组层面的变异与解读都缺。对212份伊朗与地中海橄榄种质,研究编出117,119个多态STR位点,并把天然等位系列送入AgroNT、PlantCAD2和GPN三个植物基因组语言模型,测量重复长度偏离参考等位时嵌入向量的位移。在62,847个位点上,三个模型各自筛出的敏感位点有7,417个重合,且多数位点上STR的响应超过长度匹配的非重复插入缺失。

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