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# 细胞重编程

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  1. researchsquare.com

    把基因组合搜索当成对抗攻击:GCG在单细胞基础模型里找重编程因子,同预算下优于贪心

    在单细胞基础模型里,过去只能逐个基因或枚举少量组合来预测过表达效果。九州工业大学团队把“选哪几个基因过表达”写成对基因词元的离散对抗攻击,用原本为语言模型设计的贪心坐标梯度(GCG)搜索组合。在Geneformer与scGPT上,同等前向计算预算下GCG对目标细胞状态的相似度提升均高于梯度池贪心,且优势随组合规模增大;但按已发表重编程因子计,单基因效应排序的命中率更高。

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