# siRNA 活性预测

Deep Genomics 的 DeepRNAi 把 siRNA 局部杂交位点与转录本所在基因组区域的长程上下文放进同一个预测模型，后者由 BigRNA、Enigma、REPRESS 等生物基础模型提供，覆盖多达一百万碱基对的序列。在种子介导的敲低预测上，不含基础模型的 DeepRNAi 总体表现与带人工转录本特征的传统随机森林相当；接入基础模型后性能接近翻倍。两个药物发现案例中，模型对远端 3′ UTR 位点给出接近零的活性预测，与 Alnylam 公开的 PLG 实验数据一致。

Deep Genomics 的 DeepRNAi 把 siRNA 局部杂交位点与转录本所在基因组区域的长程上下文放进同一个预测模型，后者由 BigRNA、Enigma、REPRESS 等生物基础模型提供，覆盖多达一百万碱基对的序列。在种子介导的敲低预测上，不含基础模型的 DeepRNAi 总体表现与带人工转录本特征的传统随机森林相当；接入基础模型后性能接近翻倍。两个药物发现案例中，模型对远端 3′ UTR 位点给出接近零的活性预测，与 Alnylam 公开的 PLG 实验数据一致。