# Brieno纳米孔信号基础模型

纳米孔测序的原始电流信号连续、没有天然词元，此前多按任务各建专用模型。Brieno 先用残差向量量化把信号压成离散词元，再以掩码词元预测在 1.18 亿条读段上预训练 Transformer，冻结或微调特征即可用于物种识别、条码拆分、碱基识别和甲基化检测。在留出运行上，微调 Brieno 的 CpG 5mC 读段级 AUROC 为 0.978，高于 Dorado 专用 5mCG 模型的 0.975。

纳米孔测序的原始电流信号连续、没有天然词元，此前多按任务各建专用模型。Brieno 先用残差向量量化把信号压成离散词元，再以掩码词元预测在 1.18 亿条读段上预训练 Transformer，冻结或微调特征即可用于物种识别、条码拆分、碱基识别和甲基化检测。在留出运行上，微调 Brieno 的 CpG 5mC 读段级 AUROC 为 0.978，高于 Dorado 专用 5mCG 模型的 0.975。