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  1. bioRxiv

    细胞类型不再先标注：NetMap从混合单细胞数据里同时读出调控网络与细胞身份

    单细胞调控网络推断不再需要先给细胞分型。此前流程先聚类、再用标记基因标注细胞类型，然后逐群推断网络，聚类和标注的误差会传进网络。NetMap在聚类之前就为每个细胞推断基因调控网络，再用GradientShap把网络边归因到输入基因，在PBMC多组学数据的三个评估案例上聚类分数分别为1.0、0.99和0.99。

    Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-NürnbergUniversität HamburgTechnical University of MunichUniversity of Southern Denmark
    Anne Hartebrodt（第一作者、通讯作者）David B. Blumenthal（通讯作者）
    NetMap基因调控网络推断可解释人工智能自编码器细胞类型注释

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