医学与健康
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用Google搜索数据加机器学习预测澳大利亚各州流感周报数,最佳模型相关系数从-0.353到0.977
该研究用2018至2019年Google Trends周搜索量与澳大利亚国家法定传染病监测系统(NNDSS)的流感周报数对比,为除首都领地外的各州和领地分别训练弹性网、支持向量回归、随机森林和前馈神经网络四种监督回归模型,做当周(nowcast)及提前一至两周的预测,发现搜索量与流感报告率随时间相关,随机森林与弹性网总体表现较好,除北领地和塔斯马尼亚外每个建模辖区都至少有两个搜索词与流感通报呈中度至强Pearson相关,最佳模型预测准确度(Pearson相关系数)因辖区而异(-0.353至0.977),且提前一至两周的准确度更低,人口较少的辖区准确度也更低。
在1520名受试者的四类情绪与精神病性障碍分类中,类别条件(Mondrian)校准把诊断间覆盖率差距从12.3个百分点压到0.4个百分点,代价是平均预测集仅增大0.07个标签
该工作在一个涵盖三项研究、14个采集站点、1520名受试者的四类情绪与精神病性障碍分类任务上显示,边际split-conformal校准虽达到0.9000的经验覆盖率(名义0.90),但健康对照覆盖率为0.941、分裂情感性障碍为0.818,类别条件(Mondrian)校准把这一12.3个百分点的差距降至0.4个百分点,平均预测集大小仅增加0.07个标签(不足3%),并使匹配覆盖率下的集合大小可解释为受试者属性,据此把受试者分为自信、边界、模糊与未解决四层,独立结构MRI模型标记为标签模糊的比例沿该分层单调上升(34.1%、57.3%、68.1%、81.8%;p = 8.8e-18)。
研究者逆向解析Meta Pixel配置,发现健康网站98.4%沿用默认追踪、Core Setup仅覆盖34.3%且可被哈希URL绕过
该研究提出PixelConfig差分分析框架,通过代码补丁重放与开发者账号对照实验逆向解析Meta Pixel配置,并借助Internet Archive的Wayback Machine对2017至2024年间18K健康网站与top-10K对照网站的配置做纵向比较,发现自动事件与第一方Cookie等默认开启的追踪功能采用率高达98.4%,健康网站上出现与预约就诊及特定疾病(如勃起功能障碍)按钮点击相关的潜在敏感信息追踪,而Core Setup等限制功能在健康网站采用率为34.3%、对照网站为8.7%,且启用后仍可被绕过。
DECIPHER用解耦表征学习从bulk组学中估计细胞类型比例,并在肺腺癌中支持预后分层
作者提出DECIPHER,一个端到端的表征学习框架,通过分别学习用于解卷积的域恒定表征Zc和建模域相关变异的域特异表征Zs,并结合可微非负最小二乘优化从Zc估计细胞类型比例,在模拟数据、实验生成的bulk-细胞混合样本、真实世界数据集和多种分子模态上表现出稳健且有竞争力的解卷积性能,且学到的Zc还支持跨独立队列的时序年龄预测和肺腺癌的预后分层。
基于25单元AlN PMUT阵列的柔性无线听诊器实现10 Hz–10 kHz心肺声采集,并以98.7%准确率分类五种呼吸状态
研究者开发了一种基于25单元圆形氮化铝(AlN)压电微机械超声换能器(PMUT)阵列的柔性无线可穿戴听诊器,其封装后灵敏度达−167.5 dB、工作频带10 Hz–10 kHz、频响平坦度±0.5 dB,在多名受试者中于五个标准听诊部位采集心音并与参考心电图和胸廓运动信号在时间上对应,可在行走、爬楼梯等动态活动中连续追踪心率,并借助残差神经网络对清醒、睡眠、呼吸暂停、鼾音和喘鸣五种呼吸状态实现98.7%的分类准确率。
TGFB1工程化iMSC单次关节腔注射在骨关节炎小鼠中降低滑膜巨噬细胞数量并下调MHCII/CD206比值,但未减轻软骨退变
该研究将一株多西环素诱导、hTERT永生化并过表达TGFB1的iPSC来源间充质基质细胞(TGFB1-iMSC)与多例脂肪组织来源MSC(MSC(AT))供体在预设的免疫调节与血管生成效力指标上进行比较,发现TGFB1-iMSC体积更小、更圆、增殖相当或更高,具有独特的血管生成相关基因特征(EDIL3、EDN1、PDGFA)和9个差异表达microRNA,分泌较少VEGF且HUVEC成管能力居中,但在单核-巨噬细胞transwell免疫调节实验中达到或超过所有MSC(AT)供体;在小鼠DMM创伤后骨关节炎模型中,单次关节腔注射TGFB1-iMSC(而非MSC(AT))在八周时减少滑膜巨噬细胞总
研究团队在1万株结核分枝杆菌复合群中重建IS6110插入动态,发现拷贝数从1到逾30、5%热点区域承载一半独立插入事件
该研究开发了一种无需参考基因组即可从短读序列中检测并比较插入序列的工具,对1万株结核分枝杆菌复合群(MTBC)菌株中的IS6110进行检测,结合基于存在-缺失模式的祖先状态重建,描述了MTBC中IS6110拷贝数的分布(从部分谱系的1个到La3(M. orygis)菌株的30个以上),推断其出生率随拷贝数近似线性上升且在末端分支上更高,并识别出大量平行插入的基因组区域,发现被靶向最频繁的5%区域贡献了一半的独立插入事件,靶位点与热点周围富集5'-TCTCAAAW-3'基序,据此提出一个生态位约束模型,认为IS6110在MTBC中的分布受制于兼具合适DNA性质与对宿主功能价值较低的区域之稀少。
SentZero 用抽象句映射与假阴性补丁级对齐,在 MIMIC-CXR 预训练后零样本胸部 X 光分类与定位上超过此前多任务方法
SentZero 是一个以句子为中心的胸部 X 光视觉-语言预训练框架:它用大语言模型把放射报告中的短语抽取并映射为“主题-存在性”的抽象句以扩充正样本对,用一项辅助损失把最相似的图像补丁拉向跨研究重复出现的临床句子以缓解假阴性,并对视觉嵌入施加句子条件化的残差调制;在 MIMIC-CXR 上预训练后,它在 Open-I、ChestXray14、PadChest、ChestXDet10、CheXpert 的零样本多标签分类和 ChestXDet10、MS-CXR 的零样本定位上多数指标优于此前的多任务零样本方法。
MIT团队用AI算法筛选辅料配方,使RNA疫苗室温存放一年、37摄氏度存放两个月后在小鼠中仍产生与Moderna类似疫苗相当的免疫应答
MIT研究团队与CSAIL合作开发了一种可基于小数据集做预测的机器学习算法,用它从近50种FDA已批准辅料中筛选并预测辅料配比,改造Moderna、Pfizer新冠疫苗所用的脂质纳米颗粒(LNP)配方,使疫苗经真空干燥后可在37摄氏度(约98华氏度)存放两个月、室温存放一年,接种小鼠后产生的免疫应答与类似Moderna原始配方的RNA疫苗相当,并据此制成可产生类似免疫应答的固体微针贴片。
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