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生命科学

192 条内容

  1. Biology of reproduction

    用免疫荧光染色与人工智能分析流程分割胎盘组织

    该研究开发了一个基于HALO AI的胎盘组织分类器,利用PLAP与DAPI染色将切片分割为绒毛核心、绒毛滋养层(VT)和绒毛间隙(IVS),并用SDC-1与vimentin染色验证了分类区域内面积与强度测量的准确性,在整张切片扫描图像上使染色分析面积较单个视野增加245倍。
  2. Ocular immunology and inflammation

    宏基因组深度测序在玻璃体视网膜淋巴瘤中识别与化疗耐药相关的基因突变

    该研究对49例经细胞病理学、免疫组化、流式细胞术和/或MYD88 PCR确诊的玻璃体视网膜淋巴瘤(VRL)患者的眼内标本进行宿主基因组宏基因组深度测序(MDS),并将检出的基因突变与癌症体细胞突变目录(COSMIC)数据库交叉比对,结果在4例患者的6份标本中发现8个与化疗耐药相关的基因突变,其中3例患者的4份标本携带与甲氨蝶呤(VRL主要治疗药物)耐药相关的突变,且1例患者在初次玻璃体切除及随后两次复发时的连续采样中每个时间点均检出不同的耐药相关突变,该患者虽接受包括利妥昔单抗、巩固方案和来那度胺在内的多药治疗仍最终死亡,而其余3例患者保持长期缓解。
  3. Journal of Agricultural and Food Chemistry

    食源性降压肽:制备策略、多靶点机制与机器学习进展综述

    这篇综述系统梳理了食源性降压肽的来源与新型制备策略、其多靶点作用机制与构效关系,并总结了机器学习在降压肽精准识别与活性预测中的应用,指出未来需整合先进生物技术与智能平台以加速其从实验室走向临床应用。
  4. Nature News

    风险还是稳妥?神经元“拔河”揭示大脑如何在趋避冲突中做出选择

    该报道介绍了一项发表于《自然·神经科学》的研究:研究者直接记录六名受试者眶额皮层(OFC)的电活动,发现两个相邻OFC区域在权衡风险与回报时呈实时反相关——一个区域在受试者选择追求回报前更活跃,另一个在受试者选择回避风险前更活跃,而在困难抉择中信号会在两区间快速切换后才落定。
  5. Nature News

    用AI追问衰老速度:一个面向长寿研究的专用模型与评测体系

    《Cell》报道的一项工作构建了面向衰老生物学的专用大语言模型系统,配套17项评测任务与整合研究工具和AI智能体的交互界面,并用这些基准比较了专用模型与OpenAI、DeepSeek等更大规模通用商业模型,结果显示在多数但并非全部测试中,衰老领域定制模型表现更优。
  6. bioRxiv

    nanorepertoire:面向纳米抗体库分析的端到端 Nextflow 流程

    该工作提出 nanorepertoire——一个专用于骆驼科 VHH 纳米抗体库的端到端 Nextflow DSL2 流程,将双端 AIRR-seq FASTQ 数据经质控、接头修剪、读段合并、计算机翻译、CD-HIT 克隆分型与 nanoCDR-X 深度学习 CDR3 注释,输出包含克隆结构、CDR3 长度与氨基酸组成、克隆内均一性、库多样性及运行碳足迹的交互式 HTML 报告,并在两个公开的 SARS-CoV-2 RBD 筛选羊驼文库(共 480 万双端读段)上于 16 vCPU 云实例 59 分钟内完成,回收 41,363 个不同 CDR3 抗原结合位点,重现了筛选后克隆多样性收缩的预期现象。
  7. Structure (London, England : 1993)

    AlphaBridge:预测生物分子复合物的分析工具

    该工作提出 AlphaBridge,一个结合 AlphaFold3 置信度指标、可对参与二元相互作用的序列基序及其在复合物三维界面中的分布进行聚类,并通过弦图、网络图和汇总表可视化置信范围内的相互作用界面、同时提供网页服务器版本的可复现自动化工具包,作者用二元与多组分蛋白复合物对其评分能力进行了验证并讨论了实际使用案例。
  8. Journal of medical imaging and radiation sciences

    影像组学在神经肿瘤学中的应用:进展、临床应用与实施挑战的叙述性综述

    该叙述性综述检索了PubMed、Scopus和Web of Science(2012—2024年)的文献,梳理影像组学与人工智能在神经肿瘤学中的诊断、预后和治疗潜力,指出影像组学可从MRI、CT和PET/CT中自动提取人眼难以察觉的定量特征,已显示在胶质瘤术前分类、生存预测以及区分肿瘤进展与假性进展方面具有价值,与深度学习结合可能提升诊断准确性并支持基于IDH、MGMT等分子标志物的患者分层,影像基因组学则将影像表型与基因改变相联系以促进个体化医疗,但方案缺乏标准化、分割变异以及经过验证的多中心研究稀缺等局限仍然存在,因此在最终融入临床实践之前仍需前瞻性验证与方法学标准化。
  9. Biochimie

    利什曼原虫的MAPK信号网络:结构多样性、生物学功能与治疗潜力

    这篇综述系统梳理了致病性利什曼原虫中15个MAPK同源物,将各成员与寄生虫分化、胞内存活、应激耐受、运动性、毒力及药物反应相关联,并区分了经实验验证的机制性靶点与计算预测的候选靶点,同时评估了小分子与天然产物抑制剂、药物重定位、结构导向策略以及分子动力学、AlphaFold建模、人工智能和纳米技术的应用,并指出MAPK10作为疫苗相关抗原的证据。
  10. bioRxiv

    细胞类型在描述神经元生理特征上的意外有效性

    该研究利用来自神经外科组织的495个人类神经元的配对转录组与电生理膜片钳测序数据,比较了传统转录组细胞类型分类、基于大规模scRNA-seq预训练的基础模型scGPT表征、离子通道编码基因以及高变基因对电生理特征的预测能力,发现簇级细胞类型表征总体优于高变基因选择、离子通道基因选择和上下文增强的scGPT嵌入,且最佳结果来自将独立的细胞类型模型与scGPT模型输出相结合。

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