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Sereina Riniker

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  1. Chemical Science

    神经势能也能做溶质回火:REST2-AMP/MM 无需预设反应坐标,让 chignolin 与 CLN025 从伸展链折回

    REST2 增强采样此前只用于经典力场和 QM/MM,无法直接搬进以神经网络势能描述溶质的多尺度 ML/MM 模拟。研究者利用 AMP-BMS 哈密顿量可拆成溶质—溶质、溶质—溶剂、溶剂—溶剂三部分的性质,直接缩放前两项能量,在保持溶剂温度不变的前提下做副本交换。在显式溶剂中,该方法让 chignolin 与 CLN025 从伸展构象出发折回 NMR 结构附近,Cα-RMSD 分别稳定在约 0.2–0.3 nm 和约 0.2 nm,且不需要预先指定反应坐标。

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