酶设计不再只改氨基酸:从结构直接生成大肠杆菌可表达的编码序列,Cel5E两个位点同时升温又提活
酶工程生成模型此前多在氨基酸层面优化,很少同时考虑编码序列与宿主表达。EZPro-Fit把蛋白质三维结构、编码序列和分类学信息放进同一个生成框架,先在嗜热微生物数据上预训练,再用高表达大肠杆菌基因微调,从而直接由结构生成宿主适配的编码序列。在工业内切葡聚糖酶Cel5E上,该框架给出的N291D与D259E两个变体在实验中同时提高了熔解温度和催化活性。
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酶工程生成模型此前多在氨基酸层面优化,很少同时考虑编码序列与宿主表达。EZPro-Fit把蛋白质三维结构、编码序列和分类学信息放进同一个生成框架,先在嗜热微生物数据上预训练,再用高表达大肠杆菌基因微调,从而直接由结构生成宿主适配的编码序列。在工业内切葡聚糖酶Cel5E上,该框架给出的N291D与D259E两个变体在实验中同时提高了熔解温度和催化活性。
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