TriStageHLA把表位发现拆成三步:免疫原性预测AUROC从60.1%升到81.4%
香港城市大学等团队发布TriStageHLA,把HLA-I表位发现拆成肽段初筛、等位基因特异结合预测和免疫原性预测三个串联模块。在留出的免疫原性数据上,免疫原性模块AUROC为81.4%、AUPRC为73.8%,高于ImmuneApp的70.7%/63.6%和BigMHC-IM的60.1%/51.5%;结合模块在BA/EL合并评估上AUROC为96.2%、AUPRC为95.2%。在30万条人蛋白组背景肽的模拟筛选中,初筛保留82.4%的真实候选肽并丢弃87%的背景肽。