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Ethan Baron

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  1. arXiv

    系统发育树后验推断改用迭代生成模型:复杂演化模型下比IQ-Tree更准,简单数据上持平

    系统发育树的后验推断长期依赖似然计算,而插入缺失、位点选择等真实演化过程让似然不可解。这组条件生成模型把建树拆成自底向上、自中向外或自顶向下的一步步决策,用离散扩散目标训练,在真实与合成数据上比此前的模拟推断方法Phyloformer 2更接近MCMC后验;在简单数据上与IQ-Tree持平,在更真实的复杂模型数据上稳定更准。

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