King Abdullah University of Science and Technology

该研究提出 Speciesformer，一个在 SpeciesCorpus（约1.31亿细胞、11个物种、154种组织、923种以上细胞类型）上预训练的跨物种生成式单细胞基础模型，通过进化信息引导的宏基因词汇表将物种特异基因映射到共享基因空间，其编码器学习可迁移的细胞与基因表征，其统一生成式解码器支持细胞状态与生物文本描述的双向生成以及从初始细胞状态和干预描述预测扰动后转录组，并在多项基准上报告了优于现有基线的表现。

该研究提出 Speciesformer，一个在 SpeciesCorpus（约1.31亿细胞、11个物种、154种组织、923种以上细胞类型）上预训练的跨物种生成式单细胞基础模型，通过进化信息引导的宏基因词汇表将物种特异基因映射到共享基因空间，其编码器学习可迁移的细胞与基因表征，其统一生成式解码器支持细胞状态与生物文本描述的双向生成以及从初始细胞状态和干预描述预测扰动后转录组，并在多项基准上报告了优于现有基线的表现。