City Of Hope National Medical Center

结直肠癌术后是否复发，此前主要靠淋巴血管侵犯、神经侵犯、肿瘤出芽和Ki-67等常规病理指标判断。AlphaFISH把无需测序的纳米探针生物芯片与Transformer模型结合，在149例结直肠活检样本上同时读取41个宿主转录本和51个细菌属，并在术后一年随访的28例患者中以AUC 0.81预测复发或转移，而常规临床指标组合的AUC为0.45。该结果来自未经同行评审的预印本，样本规模有限。

结直肠癌术后是否复发，此前主要靠淋巴血管侵犯、神经侵犯、肿瘤出芽和Ki-67等常规病理指标判断。AlphaFISH把无需测序的纳米探针生物芯片与Transformer模型结合，在149例结直肠活检样本上同时读取41个宿主转录本和51个细菌属，并在术后一年随访的28例患者中以AUC 0.81预测复发或转移，而常规临床指标组合的AUC为0.45。该结果来自未经同行评审的预印本，样本规模有限。

T细胞受体能否识别特定抗原，长期要靠结合实验或四聚体染色逐一确认。研究者改用AlphaFold 3预测肽-MHC-受体三元复合物，并取受体与肽-MHC界面上的预测对齐误差作为打分。在未参与训练的高质量留出集上，按抗原区分的ROC曲线下面积中位数为0.92（I类）和0.81（II类），比此前的AF2多聚体模型高0.24至0.33。

T细胞受体能否识别特定抗原，长期要靠结合实验或四聚体染色逐一确认。研究者改用AlphaFold 3预测肽-MHC-受体三元复合物，并取受体与肽-MHC界面上的预测对齐误差作为打分。在未参与训练的高质量留出集上，按抗原区分的ROC曲线下面积中位数为0.92（I类）和0.81（II类），比此前的AF2多聚体模型高0.24至0.33。