RNA序列设计改用离散扩散:不靠折叠预言机,也能生成结构匹配且彼此差异大的候选
RNA逆折叠长期依赖迭代优化和外部折叠算法打分,生成过程受初始化影响且容易收敛到局部解。该工作把多项式扩散直接定义在核苷酸序列上,用目标二级结构引导去噪,并比较二维接触图投影与一维配对感知两种架构。在同分布测试集上,二维与一维模型的中位归一化RNAforester相似度分别为0.82和0.79,生成序列的多样性接近随机序列水平。
RNA逆折叠长期依赖迭代优化和外部折叠算法打分,生成过程受初始化影响且容易收敛到局部解。该工作把多项式扩散直接定义在核苷酸序列上,用目标二级结构引导去噪,并比较二维接触图投影与一维配对感知两种架构。在同分布测试集上,二维与一维模型的中位归一化RNAforester相似度分别为0.82和0.79,生成序列的多样性接近随机序列水平。
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