冠心病多基因风险不再只给一个总分:拆成八条生物通路,同一风险水平的人可按通路区分
核心概要
冠心病多基因风险不再只汇总成一个总分。此前多基因评分只能说明谁的风险高,无法说明风险来自哪些生物过程。研究把526个全基因组显著位点按其与78项冠心病相关表型的关联做潜在因子分解,得到胆固醇富集脂蛋白、富甘油三酯脂蛋白、脂蛋白(a)、代谢不健康正常体重、肥胖、内皮功能障碍、凝血和心脏重构八个成分,并在英国生物银行、SCAPIS和Mass General Brigham生物银行中构建各自的通路特异性多基因评分,这些评分与临床冠脉事件、亚临床动脉粥样硬化及不同的生物标志物和共病谱相关。
深度剖析
冠心病遗传风险现在可以按生物过程拆开,而不是只给一个总分。 此前的多基因风险评分把数百个位点聚合成单一指标,能识别高风险个体,但不指出每个人高易感性由哪些生物过程造成。 在526个独立冠心病风险位点和78项相关表型上做潜在成分分解,50次独立运行都收敛到八个稳定成分,成分内位点数从7到50不等。
每个成分被换算成个人层面的通路特异性多基因评分,用来衡量个体在单条遗传轴上的负荷。 做法是把每个成分的位点按该成分的权重加权求和,得到八个评分;它们与总冠心病多基因评分的相关性只有中等,彼此之间相关性很低。 在英国生物银行458905人、SCAPIS 24904人和Mass General Brigham生物银行53848人中构建并检验这些评分。
八个评分与临床冠脉事件、亚临床斑块和不同的生物标志物、共病谱相关。 总评分只能给出总体关联,而这些评分显示出彼此不同的关联方向与强度。 以最高与最低十分位比较,心脏重构、脂蛋白(a)和代谢不健康正常体重的比值比分别为1.84、1.59和1.56,凝血评分最低为1.15;在未参与分解的SCAPIS人群中效应方向一致。
启示与展望
这套框架在三个大型队列中把冠心病遗传风险拆成八条生物轴,并给出每条轴的个人负荷评分,适用于以欧洲祖源为主的人群和已有深度表型与影像数据的队列。作者提出,下一步需要在针对特定脂蛋白代谢机制的干预研究中检验这些评分能否指导治疗反应。
成分的识别与解释部分取决于可用表型和细胞类型数据的强度,分解只纳入达到全基因组显著性的位点,更大位点集合可能解析出更多机制。成分主要在 predominantly 欧洲祖源人群中推导,亚洲人群八个评分中七个可重复,肥胖评分未显示关联,其他祖源需要专门的表型矩阵整理与分解。风险因素与评分的交互是观察性的,确认需要重复测量或干预试验证据。
