STING的两种激活方式在动力学上分道：配体结合把涨落聚到lid，SAVI突变改由a1b1跨区组织
核心概要
分子动力学轨迹不再只按单残基涨落来读。此前难以从高维轨迹里分离出低占比、状态相关的耦合信号。把每个残基对的侧链重原子平均距离时间序列压进25维隐空间再聚类建网后，配体结合态的网络由lid区残基对主导，SAVI相关多突变体则转向a1b1富集、跨原体并涉及281位点的分布式组织。
深度剖析
同一套残基对隐空间网络流程，在STING的三种条件下给出了不同的组织方式：配体结合态围绕lid区，SAVI相关多突变体围绕a1b1区。 此前对残基的描述依赖逐残基的汇总指标，例如均方根涨落，这类指标难以分离出低占比、状态相关的涨落模式。 在d5.5–6.0马氏距离带中，配体结合态Holo-C1的主要连通分量有49个节点、192条边，其中93.9%的节点含lid残基；多突变体Mut-C2的对应分量有31个节点、101条边，含a1b1、lid和周边LBD残基的节点分别占54.8%、41.9%和38.7%。
每个残基对由一条1800点的时间序列表示，编码器把它压成描述涨落模式的低维向量，再按相似度连成网络。 网络中的边表示隐空间描述子的相似程度，而不是残基之间的物理距离或相邻时间间隔。 流程在apo态轨迹上训练一维卷积自编码器，对时间轴做均值池化并去掉7个恒为零的维度后得到25维描述子；每条轨迹超过1微秒，取100–1000纳秒窗口、每0.5纳秒一个结构，共1800个结构，每个状态保留50403个残基对。
在突变体网络中，281位点落在一个跨区域的子网络里，而不是处在配体结合态那样的lid中心。 在配体结合态网络中，含野生型281/284的节点虽然存在，但最高度中心性的节点主要是lid及邻近LBD残基对。 Mut-C2在d5.5–6.0带中，节点191B_281B及其六个直接相连邻居构成SAVI相关子网络；该带最高度中心性节点是303A_305B，连接13个节点、度中心性0.325，其中3个连接落在该子网络内。
启示与展望
分析对象是膜嵌入的STING二聚体，显式的CTT参与和更高阶聚合不在建模范围内；多突变体是八个SAVI相关替换的组合，用于放大突变相关动态信号，属于状态层面的压力测试模型，而非特定患者基因型。每个条件使用一条超过1微秒的轨迹，比较刻画的是所分析的这三组数据。
聚类按状态分别进行，因此三种状态下数值占优的背景簇并不意味着一一对应的同一批残基对；状态相关差异集中在隐特征空间中占比很小的低密度区域。作者指出，要评估这些模式在不同运行之间是否一致，需要应用到独立轨迹。