流动细胞也能看清细胞器:三帧结构光加自监督重建,每秒约720个细胞达约118纳米
核心概要
超分辨成像流式细胞术(SR-IFC)把结构光照明显微镜搬进连续流动的微流道:每个细胞只取三帧相移图像,沿流动方向由物理调制提升分辨率,横向缺失的细节由仅用本样本数据训练的网络补出。在100纳米荧光珠上,SR-IFC沿流动与横向分别达到约118纳米和110纳米分辨率,而同一批珠子的宽场成像为222至227纳米;在2048×320像素读出下,理论吞吐上限约为每秒720个细胞。
深度剖析
连续流动中的细胞现在可以在细胞器尺度上被逐个成像,而不只是测到细胞整体的大小和形状。 此前的成像流式细胞术受衍射极限限制,200纳米以下的细胞器结构无法分辨;把超分辨方法接入流动的少数尝试中,图像扫描与结构光片方案把分辨率提高一倍,但速率只有约每秒1到10个细胞,比流式低两个数量级。 在100纳米荧光珠上,SR-IFC沿流动轴与横向的半高全宽分别为约155纳米和149纳米,扣除珠子直径后对应约118纳米和110纳米,而同一批珠子的宽场成像分辨率为222至227纳米,约两倍提升。
分辨率提升只靠三帧单方向结构光图像,横向细节由网络从被测细胞自身的数据中推断。 常规结构光显微镜需要多个光栅方向、通常共九帧才能得到各向同性面内分辨率,这在细胞穿越视场的毫秒窗口内无法完成。 在三种结构不同的模拟体模上,SR-IFC的像素误差、结构相似度与傅里叶振幅误差都接近九帧结构光的结果;任务分辨率上,SR-IFC在珠对与椭球体模上达到结构光水平,在频率体模上为0.75对0.72,并在峰值相对散粒噪声从0%升到50%时保持与结构光参考接近。
流动带来的帧间位移由数据本身估计并校正,使连续流下的细胞器成像不依赖精确的流速控制。 在运动平台上,珠子帧间位移几乎一致;连续流中每个细胞在三帧里出现在不同且未知的位置,位移逐细胞变化,而结构光重建要求把三帧当作同一物体的相移视图对齐。 以25毫米每秒流动的MitoTracker Green标记Jurkat细胞为例,互相关配准后重建无伪影,SR-IFC分辨出宽场与单方向结构光图像中模糊或粘连的线粒体碎片与管状结构。
启示与展望
已展示的能力限于单色荧光通道、二维面内成像,物理结构光只沿流动轴施加;吞吐量受相机读出区域限制,成像面积与采集速度之间存在取舍,且方法要求三帧相移图像能被准确配准,这约束了可用的最高流速。读者对象是从事流式细胞术、超分辨显微与单细胞表型分析的研究人员和工程师。
分辨率提升目前只在单色通道和二维面内得到验证;吞吐量受相机读出高度限制,较大的细胞需要更高的读出区域因而速率更低;CD8+ T细胞的形态轨迹来自单一健康供体,融合型形态与中央记忆群体的对应较弱,其与中央记忆的关系仍需进一步验证;由于细胞经过反复刺激,部分碎片型形态可能反映耗竭相关重塑,而该研究未检测耗竭标志物。
